Biostatistiques et contrôle qualité

Outils pédagogiques de statistique et de contrôle de qualité au laboratoire. Ils ne prennent aucune décision de validation : celle-ci relève du biologiste et du plan de contrôle du laboratoire.

Statistiques descriptives : moyenne, écart-type, CV, IC 95 %

Moyenne, médiane, écart-type, variance, coefficient de variation et intervalle de confiance de la moyenne d’une série.

Données à saisir
Une valeur par ligne, ou séparées par des espaces ou des points-virgules. La virgule sert aux décimales.

Formule

Moyenne x̄ = Σx / n ; écart-type s = √(Σ(x − x̄)² / (n − 1)) ; CV (%) = s / x̄ × 100

IC 95 % = x̄ ± t(0,975 ; n − 1) × s / √n.

Unités

Unité des valeurs saisies ; CV en %.

Exemple

4,8 ; 5,1 ; 5,0 ; 4,9 ; 5,2 : moyenne 5,00 ; écart-type 0,158 ; CV 3,16 % ; IC 95 % 4,80 à 5,20.

Limites

  • L’intervalle de confiance suppose des mesures indépendantes et une distribution proche de la normale.
  • Une étude d’imprécision utilise généralement au moins 20 mesures.

Références

  1. NIST/SEMATECH e-Handbook of Statistical Methods — statistiques descriptives et intervalles de confiance.

Formule vérifiée par rapport aux références ci-dessus le 12 octobre 2026.

Biais, erreur relative, récupération et z-score

Biais absolu et relatif par rapport à une valeur cible, taux de récupération d’une surcharge, z-score d’un résultat.

Données à saisir
Calcul

Formule

Biais = mesuré − cible ; biais relatif (%) = (mesuré − cible) / cible × 100

Récupération (%) = (surchargé − base) / ajouté × 100 ; z = (résultat − moyenne) / écart-type.

Unités

Même unité pour toutes les valeurs d’un calcul.

Exemple

Moyenne mesurée 5,2 pour une cible de 5,0 : biais de 0,2, soit 4,0 %.

Limites

  • Le biais s’estime sur la moyenne de mesures répétées d’un matériau de valeur assignée.
  • L’acceptabilité se juge par rapport à une spécification définie à l’avance (erreur totale admissible, variabilité biologique).

Références

  1. NIST/SEMATECH e-Handbook of Statistical Methods — statistiques descriptives et intervalles de confiance.

Formule vérifiée par rapport aux références ci-dessus le 12 octobre 2026.

Graphique de Levey-Jennings et règles de Westgard

Graphique de contrôle d’une série de résultats de contrôle interne et détection des règles 1-2s, 1-3s, 2-2s, R-4s, 4-1s et 10x.

Données à saisir
Une valeur par ligne, ou séparées par des espaces ou des points-virgules. La virgule sert aux décimales.

Formule

z = (résultat − moyenne) / écart-type.

1-2s : |z| > 2 (alerte) ; 1-3s : |z| > 3 ; 2-2s : deux résultats consécutifs au-delà de 2 s du même côté ; R-4s : deux résultats consécutifs de part et d’autre au-delà de 2 s ; 4-1s : quatre consécutifs au-delà de 1 s du même côté ; 10x : dix consécutifs du même côté de la moyenne.

Unités

Unité du contrôle ; z sans unité.

Exemple

Moyenne 5,0 et écart-type 0,1 : le 5e résultat déclenche la règle 2-2s et le 7e la règle 1-3s, soit 2 points de rejet.

Limites

  • Usage pédagogique. Les règles sont appliquées à une seule série de contrôle, dans l’ordre chronologique ; en pratique, elles s’appliquent aussi entre niveaux de contrôle d’une même série.
  • L’outil ne valide ni ne bloque des résultats de patients : cette décision relève du biologiste et du plan de contrôle du laboratoire.
  • Moyenne et écart-type cibles doivent être établis par le laboratoire (et non repris du fournisseur sans vérification).

Références

  1. Westgard JO, Barry PL, Hunt MR, Groth T. A multi-rule Shewhart chart for quality control in clinical chemistry. Clin Chem. 1981;27(3):493-501.
  2. Levey S, Jennings ER. The use of control charts in the clinical laboratory. Am J Clin Pathol. 1950;20(11):1059-1066.

Formule vérifiée par rapport aux références ci-dessus le 12 octobre 2026.

Performances d’un test : sensibilité, spécificité, VPP, VPN

Sensibilité, spécificité, valeurs prédictives, rapports de vraisemblance et intervalles de confiance à partir d’un tableau 2 × 2.

Données à saisir
Pour recalculer VPP et VPN à cette prévalence.

Formule

Se = VP / (VP + FN) ; Sp = VN / (VN + FP) ; VPP = VP / (VP + FP) ; VPN = VN / (VN + FN)

RV+ = Se / (1 − Sp) ; RV− = (1 − Se) / Sp. IC 95 % par la méthode du score de Wilson.

Unités

Effectifs entiers ; résultats en %.

Exemple

VP 90, FP 20, FN 10, VN 180 : sensibilité 90,0 % (IC 95 % 82,6–94,5), spécificité 90,0 %, VPP 81,8 %, VPN 94,7 %, RV+ 9,00.

Limites

  • VPP et VPN dépendent de la prévalence : ceux de l’échantillon ne valent que pour une population de même prévalence.
  • Les performances dépendent du choix de la méthode de référence et de la population étudiée (biais de spectre).

Références

  1. Wilson EB. Probable inference, the law of succession, and statistical inference. J Am Stat Assoc. 1927;22(158):209-212.
  2. NIST/SEMATECH e-Handbook of Statistical Methods — statistiques descriptives et intervalles de confiance.

Formule vérifiée par rapport aux références ci-dessus le 12 octobre 2026.

Comparaison de deux méthodes (Bland-Altman)

Biais moyen et limites d’agrément entre deux méthodes mesurant les mêmes échantillons.

Données à saisir
Une valeur par ligne, ou séparées par des espaces ou des points-virgules. La virgule sert aux décimales.

Formule

d = A − B pour chaque échantillon ; biais = moyenne des d ; limites d’agrément = biais ± 1,96 × écart-type des d.

Unités

Même unité pour les deux méthodes.

Exemple

Cinq échantillons : biais moyen (A − B) de -0,30 ; limites d’agrément de -0,92 à 0,32.

Limites

  • Le caractère acceptable des limites se juge par rapport à un critère défini à l’avance.
  • Si l’écart varie avec la concentration, analyser les différences relatives (%) ; une étude de comparaison utilise généralement au moins 40 échantillons couvrant l’intervalle de mesure.

Références

  1. Bland JM, Altman DG. Statistical methods for assessing agreement between two methods of clinical measurement. Lancet. 1986;1(8476):307-310.

Formule vérifiée par rapport aux références ci-dessus le 12 octobre 2026.