Bactériologie Procédures Pratiques

Procédure Pratique d’un ECBU (Examen Cytobactériologique des Urines)

L’ECBU est un examen microbiologique permettant de rechercher :

  • une infection urinaire,
  • des leucocytes,
  • des hématies,
  • des bactéries ou levures,
  • et d’identifier le germe responsable avec antibiogramme.

Voici la Procédure Pratique d’un ECBU simplifiée:


1. Matériel nécessaire

  • Gants
  • Blouse
  • Désinfectant
  • Étiquettes d’identification
  • Tube ou flacon stérile pour urine
  • Anse calibrée (1 µL ou 10 µL)
  • Lames et lamelles
  • Centrifugeuse
  • Microscope
  • Milieux de culture :
    • Gélose CLED
    • Gélose chromogène urinaire
    • Gélose sang
    • MacConkey (selon laboratoire)
  • Étuve à 35–37°C
  • Automate ou galerie d’identification API
  • Disques antibiotiques / automate antibiogramme

2. Phase pré-analytique

A. Conditions de prélèvement

Urines du milieu de jet

Le patient doit :

  1. Se laver les mains.
  2. Faire une toilette intime :
    • femme : écarter les lèvres,
    • homme : décalotter si possible.
  3. Éliminer le premier jet urinaire.
  4. Recueillir le milieu du jet dans le flacon stérile sans toucher l’intérieur.
  5. Refermer immédiatement.

B. Cas particuliers

Sonde urinaire

  • Ne jamais prélever dans le sac collecteur.
  • Désinfecter le site de prélèvement.
  • Ponction aseptique avec seringue stérile.

Nourrisson

  • Poche stérile urinaire à changer chaque 30 minutes ou sondage selon protocole.

C. Transport et conservation

  • Acheminer rapidement (<2 h).
  • Si retard :
    • conservation à 4°C maximum 24 h,
    • ou tube avec conservateur boraté.

3. Réception au laboratoire

Vérifier :

  • identité,
  • heure prélèvement,
  • aspect des urines,
  • volume suffisant,
  • conformité du prélèvement.

Noter :

  • couleur,
  • turbidité,
  • odeur éventuelle.

4. Examen macroscopique

Observer :

  • urine claire,
  • trouble,
  • hématurique,
  • purulente,
  • présence de dépôts.

Bandelette réactive:

La bandelette réactive est un test rapide et non invasif permettant de dépister une infection urinaire (cystite) en quelques minutes, souvent avant de prescrire un Examen Cytobactériologique des Urines (ECBU) pour confirmer. Elle détecte principalement les leucocytes (globules blancs) et les nitrites dans l’urine, signalant une possible infection.

  • Principe : Des réactifs chimiques changent de couleur sur la bandelette en présence de composants spécifiques (leucocytes, nitrites, sang, protéines).
  • Signes d’infection : La présence de leucocytes (>10/mm3) et/ou de nitrites est fortement évocatrice d’une infection urinaire.
  • Utilisation :
    • Réalisation : Immerger la bandelette 1 seconde dans l’urine, puis lire le résultat (en comparant avec l’échelle de couleurs) après 1 à 2 minutes (2 minutes pour les leucocytes).
  • Notez les résulats obtenus.

5. Examen cytologique (microscopique)

A. Homogénéisation

Mélanger doucement l’échantillon.


B. Examen à l’état frais

Déposer une goutte entre lame et lamelle.

Observer au microscope :

  • leucocytes,
  • hématies,
  • cellules épithéliales,
  • cylindres,
  • cristaux,
  • levures,
  • bactéries.

Faire le décompte des leucocytes et les hématies sur Cellules de Malassez.


D. Interprétation cytologique

Leucocyturie significative

≥ 10⁴ leucocytes/mL ( 10 cellules sur cellules de Malassez)

Hématurie

Présence anormale d’hématies.

Nombreuses cellules épithéliales

→ suspicion de contamination.


6. Examen bactériologique

A. Ensemencement

Utiliser une anse calibrée de 10 µL :

  • 1 µL = multiplication ×1000
  • 10 µL = multiplication ×100

B. Technique

  1. Tremper l’anse verticalement.
  2. Ensemencer la gélose par stries.
  3. Utiliser :
    • CLED,
    • chromogène,
    • MacConkey pour isoler les enterobacteries ,
    • gélose sang selon protocole.

7. Incubation

  • 35–37°C
  • aérobiose ou anaérobiose..

Parfois prolonger à 48 h.


8. Lecture des cultures

A. Quantification bactérienne

Compter les colonies.

Exemple

Avec anse 10 µL :

  • 10 colonies = 10⁴ UFC/mL.

B. Seuils classiques

≥10⁵ UFC/mL

→ infection probable.

10⁴–10⁵ UFC/mL

→ interprétation selon clinique.

<10⁴ UFC/mL

→ souvent contamination.


9. Identification bactérienne

Germes fréquents :

  • Escherichia coli
  • Klebsiella pneumoniae
  • Proteus mirabilis
  • Enterococcus faecalis
  • Staphylococcus saprophyticus

Méthodes :

  • galerie biochimique,
  • automate,
  • MALDI-TOF,
  • tests enzymatiques.

10. Antibiogramme

Réalisé si culture significative.

Méthodes :

  • diffusion disque,
  • automate,
  • E-test.

Interprétation selon :

  • EUCAST,
  • CASFM.

11. Compte rendu type

ECBU négatif

  • Absence de bactériurie significative.

ECBU positif

Exemple :

  • leucocyturie importante,
  • culture monomicrobienne,
  • Escherichia coli : 10⁵ UFC/mL,
  • antibiogramme joint.

12. Critères de contamination

Évoquer contamination si :

  • plusieurs germes,
  • nombreuses cellules épithéliales,
  • faible numération,
  • mauvais prélèvement.

13. Principales erreurs à éviter

  • prélèvement non stérile,
  • conservation prolongée à température ambiante,
  • prélèvement dans sac urinaire,
  • anse mal calibrée,
  • mauvaise incubation,
  • confusion contamination/infection.

14. Sécurité au laboratoire

  • Respect des précautions standard.
  • Gants obligatoires.
  • Désinfection des surfaces.
  • Élimination DASRI.
  • Manipulation aseptique.

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